设在英国的咨询公司Frontier Economics发布名为《南苏丹：战争代价》的调查报告，量化了自2015年1月起南苏丹内战延长将给本国和邻国以及国际社会造成的直接与间接经济损失。如未来内战持续1-5 年，南苏丹经济损失将达223亿美元至280亿美元，经济增长率下降15%；其邻国经济损失达12亿美元，经济增长率下降1%。如内战恶化，肯尼亚、坦桑尼亚和乌干达的GDP将在5年内分别损失9%、4.7%和4.5%。

　　乌干达是南苏丹最大贸易伙伴之一，许多原本在南苏丹从事贸易的乌干达商人返回，导致乌干达侨汇收入锐减。肯尼亚商业银行在南苏丹境内有19个网点，是南苏丹最大银行，但目前已关闭3个网点。南苏丹内乱还直接影响到东非跨境基础设施项目南苏丹-拉穆-埃塞俄比亚交通走廊项目的实施。